加格達奇區，隸屬於黑龍江省大興安嶺地區，地處黑龍江省轄區西北部、內蒙古自治區東北部、大興安嶺山脈東南坡，在內蒙古自治區呼倫貝爾市鄂倫春自治旗境內。全區共轄6個街道、2個鄉，總面積1587平方千米。嫩江水系較大的'一條河，甘河，由西向東在境內透過，區段長55公里。
加格達奇區地處大興安嶺餘脈，山勢平緩，起伏不大，屬低山丘陵地帶。地勢西北高，東南低，低山丘陵分佈在城區的周圍，大部分平川分佈在甘河南北兩岸。平均海拔為472米。