與蛋白質相關的三種計算解題策略

  與蛋白質相關的計算題,題型較多,難度較大。但總體上可分為三種類型,且每類題型都有相應的解題策略。如下表:
 
題目型別 解題策略
有關蛋白質的相對分子質量、氨基酸數、氨基數、羧基數、肽鏈數、肽鍵數、脫水數的計算 列方程求解
蛋白質***或多肽***中原子數計算 用原子守恆解答
多肽種類計算 用數學中“排列組合”解答
>  1.蛋白質中氨基酸、氨基、羧基、肽鏈、肽鍵、脫水數及蛋白質的相對分子質量的計算

  [方法依據] 可將肽鏈看作“C”與“—CO—NH—”交替連線構成的基本骨架,在“C”上連線著R基和H,在肽鏈的兩端分別是遊離的“—NH2”和“—COOH”,如下圖所示:

  [妙法指津] 結合上面的示意圖,可以得出如下規律:

  ***1***縮合時脫去的水分子數=肽鍵數=氨基酸數-肽鏈數。

  ***2***蛋白質中氨***羧***基數=肽鏈數+R基上的氨***羧***基數=各氨基酸中氨***羧***基的總數-肽鍵數。

  注意 如果不考慮R基上的氨***羧***基數,一條多肽鏈中,至少含有一個遊離氨***羧***基;若蛋白質分子由多條肽鏈構成,則至少含有的氨***羧***基數等於肽鏈數。

  ***3***蛋白質的相對分子質量=氨基酸總相對分子質量***氨基酸個數×氨基酸平均相對分子質量***-失水量***18×脫去的水分子數***。

  注意 有時還要考慮其他化學變化過程,如肽鏈上出現二硫鍵***—S—S—***時,要再減去2***即兩個H***。

  ***4***若為環狀多肽,則可將公式中的肽鏈數視為零,再進行相關計算。

  [典例剖析] 已知氨基酸的平均相對分子質量為128,測得某蛋白質的相對分子質量為5 646,則組成該蛋白質的氨基酸數、肽鏈數以及至少遊離的氨基數分別為 ***  ***

  A.51、1、51 B.51、2、2

  C.51、2、51 D.44、2、2

  解析 解題時可採用“列方程求解”的方法。設氨基酸數為n,肽鏈數為x,則n×128=5 646+***n-x***×18,化簡得110n+18x=5 646。當x=1時,n≈51.16;當x=2時,n=51。因此只有B、C項的數值符合氨基酸數和肽鏈數。又知兩條肽鏈上至少遊離著2個氨基,故B項正確。

  答案 B

  2.多肽中各原子數的計算

  [方法依據] 氨基酸的結構通式是解答此類題目的突破口。在一個氨基酸中,若不考慮R基,至少含有2個碳原子、2個氧原子、4個氫原子和1個氮原子。而脫水縮合形成多肽時,要失去部分水分子,但是碳原子、氮原子的數目不會減少。

  [妙法指津] ***1***碳原子數=氨基酸的分子數×2+R基上的碳原子數。

  ***2***氫原子數=各氨基酸中氫原子的總數-脫去的水分子數×2。

  ***3***氧原子數=各氨基酸中氧原子的總數-脫去的水分子數。

  ***4***氮原子數=肽鏈數+肽鍵數+R基上的氮原子數=各氨基酸中氮原子的總數。

  ***5***由於R基上的碳原子數不好確定,且氫原子數較多,因此以氮原子數或氧原子數的計算為突破口,計算氨基酸的分子式或氨基酸個數最為簡便。

  [典例剖析] 某多肽鏈為199肽,其分子式為CxHyNaObS2***a>199、b>200***,並且由下列5種氨基酸組成。那麼該多肽徹底水解後將會分別得到賴氨酸、天冬氨酸的個數為

  ***  ***

  A.a-199、***b-200***/2 B.a-200、b-200

  C.a-199、***b-199***/2 D.a-200、***b-200***/2

  解析 由題意知該多肽為199肽,則它是由199個氨基酸組成的;又知該多肽分子式為CxHyNaObS2,其中N有a個,則可知組成該多肽的199個氨基酸共有a個氨基;又知組成該多肽的5種氨基酸中只有賴氨酸含有2個氨基,所以賴氨酸個數為a—199。由於組成該多肽的5種氨基酸中只有天冬氨酸含有2個羧基,設該多肽共含有d個天冬氨酸,反應前199個氨基酸中氧原子共有4d+***199-d***×2,形成199肽時脫去198個水分子,每個水分子含一個氧原子,所以該多肽分子中尚存在氧原子數為b=4d+***199-d***×2-198=2d+200,d=***b-200***/2。

  答案 A

  3.多肽種類的計算

  [方法依據] 多肽的不同取決於氨基酸的數目、種類和排列順序。對於氨基酸數目相同的多肽來說,則取決於氨基酸的種類和排列順序。可以藉助下面的示意圖***?代表要安放的氨基酸的位置***,結合數學中“排列組合”的相關知識,推匯出相關的計算規律。***以20種氨基酸形成的四肽化合物為例***

  [妙法指津] ***1***若每種氨基酸數目無限***允許重複***的情況下,可形成肽類化合物的種類有204種***即1號位置安放氨基酸的情況有20種,2、3、4號也是如此,即20×20×20×20=204種***。

  ***2***若每種氨基酸只有一個***不允許重複***的情況下,可形成肽類化合物的種類有***20×19×18×17***種[即1號位置安放氨基酸的情況有20種,2號位置安放的氨基酸只能在剩餘的19種中選擇……即***20×19×18×17***種]。

  [典例剖析] 現有足量的甘氨酸、丙氨酸、穀氨酸3種氨基酸,它們能形成的三肽種類以及包含3種氨基酸的三肽種類分別最多有 ***  ***

  A.9種,9種 B.6種,3種

  C.18種,6種 D.27種,6種

  解析 由上述“妙法指律中的***1***”很容易計算出足量的3種氨基酸構成的三肽有33=27種。對於包含3種氨基酸的三肽種類的理解,可借用示意圖“?—?—?”來分析,即第一個位置的氨基酸有3種情況,第二個位置只能從另外2種氨基酸中任選1種,第三個位置只能安放剩餘的1種,雖然這3種氨基酸足量,但是仍需按“妙法指律中的***2***”計算,即3×2×1=6種。

  答案 D